Hlavní funkcí pufru PCR (Polymerase Chain Reaction) je poskytnout vhodné prostředí pro enzym DNA polymerázu, aby mohl efektivně fungovat během procesu amplifikace. Konkrétně PCR pufr obvykle plní několik klíčových rolí:
- Stabilizace pH: Pufr udržuje optimální hladinu pH (obvykle kolem 8,0), která je nezbytná pro aktivitu DNA polymerázy.
- Iontová síla: Poskytuje vhodnou iontovou sílu, která je klíčová pro aktivitu enzymu a stabilitu duplexu DNA během kroků denaturace a nasedání.
- Hořčíkové ionty: Většina PCR pufrů obsahuje hořečnaté ionty (Mg²⁺), které jsou nezbytnými kofaktory pro aktivitu DNA polymerázy. Pomáhají stabilizovat strukturu DNA a usnadňují enzymatickou reakci.
- Rozpustnost nukleotidů: Pufr zvyšuje rozpustnost nukleotidů (dNTP) a dalších složek a zajišťuje, že jsou dostupné pro polymerázu pro začlenění do rostoucího řetězce DNA.
Celkově PCRvyrovnávací paměťvytváří optimální biochemické prostředí pro amplifikaci specifických sekvencí DNA.
